Une équipe espagnole crée le premier catalogue mondial de « cicatrices » dans l’ADN humain.

L'ADN, la molécule qui stocke les instructions vitales, est constamment endommagé : par le fonctionnement même de la cellule, par l'exposition au soleil, ou même lors de certains traitements médicaux. Réparer ces dommages est essentiel à la survie cellulaire, mais chaque réparation laisse une trace, une « cicatrice » génétique qui peut révéler à la fois l'origine du dommage et la façon dont la cellule l'a traité.
Une équipe dirigée par le Centre national espagnol de recherche sur le cancer (CNIO) a créé le premier catalogue mondial de ces empreintes digitales, appelé « réparome humain » (REPAIRome). Il s'agit d'une ressource ouverte et innovante qui décrit comment les près de 20 000 gènes humains influencent les schémas de réparation de l'ADN. Les données sont publiées dans la revue Science .
L’équipe du CNIO a généré 20 000 populations cellulaires, chacune avec un gène inactivé, et a ensuite provoqué des cassures dans leur ADN à l’aide de l’outil CRISPR.
En analysant la manière dont ces blessures génétiques ont été « cousues », ils ont identifié 20 000 modèles de cicatrices distincts.
Selon les chercheurs, décoder ces cicatrices n'est pas seulement une simple prouesse biologique : cela pourrait avoir des applications cliniques directes. Par exemple, les tumeurs développent souvent une résistance aux traitements en apprenant à réparer les dommages causés par les médicaments ou la radiothérapie. Identifier les mécanismes de réparation actifs dans chaque cas pourrait permettre de développer des thérapies plus efficaces et personnalisées.

L’étude a également détecté des modèles de mutation associés au cancer du rein et à des conditions hypoxiques dans d’autres tumeurs, ce qui ouvre la porte à de nouvelles stratégies thérapeutiques.
Felipe Cortés , auteur principal de l'article, explique que les mécanismes de réparation de l'ADN sont essentiels à la santé. S'ils échouent, les mutations s'accumulent, favorisant le cancer et le vieillissement. De plus, de nombreux traitements antitumoraux reposent sur l'induction de cassures de l'ADN. Les voies de réparation constituent donc des cibles thérapeutiques clés et permettent la conception de thérapies personnalisées.
Outre son intérêt dans la lutte contre le cancer, le réparome humain pourrait améliorer la précision des outils d'édition génétique, tels que CRISPR-Cas, qui fonctionnent en induisant précisément des cassures dans l'ADN. Comprendre comment ces cassures sont réparées permettra de mieux contrôler les résultats de l'édition génétique.
« REPAIRome est une plateforme de découvertes », soulignent les auteurs. Son champ d'application est vaste, allant de nouvelles cibles thérapeutiques contre le cancer à un meilleur contrôle des technologies de génie génétique.
Les informations ont été organisées dans un portail Web ouvert à la communauté scientifique, permettant aux chercheurs du monde entier d’explorer comment chaque gène influence la réparation de l’ADN.
« Nous espérons que cela deviendra une ressource véritablement utile dans la recherche sur le cancer et la pratique clinique », ajoute Cortés.
abc